ศูนย์เครือข่ายบริการเทคโนโลยีขั้นสูงด้านการปรับปรุงพันธุ์พืช
BReeDServe
เพื่อความสามารถในการแข่งขันของอุตสาหกรรมปรับปรุงพันธุ์พืชไทย
- เป็นหน่วยงานบริการวิจัย พัฒนา และฝึกอบรมที่ศูนย์เทคโนโลยีชีวภาพเกษตรมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ จัดตั้งขึ้นเพื่อตอบสนองต่อการพัฒนาของอุตสาหกรรมเมล็ดพันธุ์ และปรับปรุงพันธุ์พืชของประเทศไทย
R&D Service
Genotyping
- DArTseq/GBS
- MAS
- Genome Sequencing
Phenotyping
- Biotic Stress
- Abiotic Stress
- Germplasm
Bioinformatics
- SNP/SSR detection
- QTL mapping
- Genomic selection
- AgCipher Server
Others
- Double haploid
- Tissue culture
- Ploidy analyzer
Activities & Programs
Forum Conference
- National Conference
- International Conference
Training
- Short term training
- Long term training
Genomics Services
DArT-Seq
การให้บริการแก่นักปรับปรุงพันธุ์ทั้งในภาครัฐและเอกชน โดยการใช้เทคโนโลยีขั้นสูงจากความร่วมมือกับหน่วยงาน Diversity Arrays Technology (DArT) Pty. Ltd. ประเทศออสเตรเลีย เป็นการใช้เทคโนโลยีด้าน Next Generation Sequencing (NGS) เพื่อส่งเสริมงานด้านปรับปรุงพันธุ์ทั้งในพืชและสัตว์
ด้วยเทคนิค DArTseq ซึ่งเป็นการต่อยอดของเทคนิค GBS (genotype by sequencing) นับเป็นเทคนิคที่ทำการวิเคราะห์ข้อมูลในระดับจีโนมที่มีความละเอียดสูง โดยให้บริการวิเคราะห์ข้อมูลจีโนมชนิด SNP (single nucleotide polymorphism) และ small insertion/deletion ในการประเมินเชื้อพันธุกรรม
ระยะเวลาในการวิเคราะห์ดีเอ็นเอ ขึ้นกับความซับซ้อนของจีโนม โดยเฉลี่ยใช้เวลาประมาณ 8–10 สัปดาห์
Flow Cytometry Service
การให้บริการตรวจชุดโครโมโซมพืชด้วยเครื่อง Flow Cytometer เพื่อวิเคราะห์ปริมาณดีเอ็นเอและประเมินระดับพลอยดี (ploidy level) อย่างแม่นยำ
รายละเอียดเพิ่มเติมBioinformatics Services
Blast2GO
A bioinformatics platform for high-quality protein function prediction and functional analysis of genomic datasets.
Specification
- หน่วยประมวลผลกลาง: Intel Xeon E7-8880 v3 2.3GHz จำนวน 4 ตัว ประสิทธิภาพรวม 72 computing cores
- หน่วยความจำหลัก: ความจุรวม 1.24 TB
- ระบบจัดเก็บข้อมูล: ระบบปกป้องการสูญหายของข้อมูลด้วย RAID Controller 6
- ระบบปฏิบัติการ: Linux CentOS 7
สำหรับนักวิจัยในเครือข่ายฯ
ติดต่อขอ Account และข้อมูลการใช้งานเพิ่มเติมได้ที่ ห้อง A323 สายใน 311 ภูมิพัฒน์
kpsppto@ku.ac.thDatabases and Tools
Plant Genomics Databases
Mango DB
Mangifera indica L. cv. Srisaket (Kaew) 007 genome database.
Thai chili DB
Thai chili landrace database.
Oil palm SNP DB
The whole genome oil palm SNP database.
Luffa germplasm DB
Thailand ridge gourd germplasm database.